- การทำความเข้าใจและการสร้างโปรตีน ซึ่งเป็นองค์ประกอบพื้นฐานของทุกโรค อาจนำไปสู่ยาและวิธีการรักษาแบบใหม่ได้
- ปัจจุบัน กระบวนการออกแบบโปรตีนในห้องปฏิบัติการต้องใช้การคำนวณและทรัพยากรจำนวนมาก รวมถึงการสร้างโครงสร้างโปรตีนและลำดับกรดอะมิโน
- EvoDiff ทำให้กระบวนการนี้ง่ายขึ้น โดยสร้างโปรตีนคุณภาพสูงและหลากหลายจากลำดับโปรตีนที่กำหนด โดยไม่ต้องใช้ข้อมูลโครงสร้างของโปรตีนเป้าหมาย
- EvoDiff ที่เป็นโอเพนซอร์สสามารถนำไปใช้สร้างวิธีการรักษาใหม่ วิธีส่งยา และเอนไซม์สำหรับปฏิกิริยาเคมีในภาคอุตสาหกรรมได้
- ระบบทำงานตามหลักการที่ว่า 'ลำดับโปรตีนคือทุกสิ่ง' โดยออกแบบโปรตีนใหม่ด้วยการก้าวออกจากแนวคิดโครงสร้าง-หน้าที่ในวิศวกรรมโปรตีน
- เฟรมเวิร์ก EvoDiff อิงกับโมเดลขนาด 640 ล้านพารามิเตอร์ที่ฝึกด้วยข้อมูลจากสายพันธุ์และคลาสหน้าที่ของโปรตีนที่หลากหลาย ซึ่งนำมาจากชุดข้อมูล OpenFold และ UniRef50
- เป็นโมเดล diffusion คล้ายกับโมเดลสร้างภาพสมัยใหม่ โดยเรียนรู้ที่จะค่อย ๆ กำจัด noise จากโปรตีนตั้งต้นที่แทบทั้งหมดเป็น noise และขยับเข้าใกล้ลำดับโปรตีนมากขึ้น
- สามารถสร้างโปรตีนใหม่ เติมช่องว่างของการออกแบบโปรตีนเดิม และตอบโจทย์เป้าหมายด้านหน้าที่เฉพาะได้
- การออกแบบโปรตีนในพื้นที่ของลำดับแทนที่จะเป็นโครงสร้าง ทำให้สามารถสังเคราะห์โปรตีนไร้ระเบียบซึ่งมีบทบาทสำคัญในชีววิทยาและโรคได้
- งานวิจัยนี้ยังไม่ได้ผ่านการประเมินโดยผู้ทรงคุณวุฒิ และยังต้องมีการขยายงานเพิ่มเติมก่อนที่เฟรมเวิร์กจะนำไปใช้เชิงพาณิชย์ได้
- ทีม EvoDiff มีแผนทดสอบโปรตีนที่โมเดลสร้างขึ้นในห้องปฏิบัติการเพื่อประเมินความเป็นไปได้ในการใช้งาน และหากสำเร็จ จะเริ่มงานพัฒนารุ่นถัดไปของเฟรมเวิร์ก
ยังไม่มีความคิดเห็น