AlphaFold - โซลูชันสำหรับปัญหาการพับตัวของโปรตีน

• โมเดลโครงข่ายประสาทเทียมที่พัฒนาโดย DeepMind เพื่อแก้ปัญหาการพับตัวของโปรตีน

ปัญหาการพับตัวของโปรตีน

• โปรตีนเป็นโครงสร้างที่ซับซ้อนซึ่งเกิดจากกรดอะมิโนเชื่อมต่อกันเป็นสายโซ่และพับตัวเป็นโครงสร้างสามมิติ

• โปรตีนมีหน้าที่หลากหลาย ขึ้นอยู่กับกรดอะมิโนที่ประกอบกันและโครงสร้างที่พับตัวแล้ว

• อย่างไรก็ตาม การคาดการณ์โครงสร้างของโปรตีนจากเพียงลำดับของกรดอะมิโนนั้นเป็นเรื่องยากมาก

AlphaFold

• เรียนรู้จากข้อมูลโครงสร้างโปรตีนราว 170,000 รายการใน Protein Data Bank และข้อมูลโปรตีนอื่น ๆ ที่ยังไม่ทราบโครงสร้าง

• ใช้ TPUv3 ประมาณ 128 คอร์ในการฝึกเป็นเวลาหลายสัปดาห์

CASP(Critical Assessment of protein Structure Prediction)

• การแข่งขันทำนายโครงสร้างโปรตีนระดับโลกที่จัดขึ้นทุก 2 ปี โดยเริ่มครั้งแรกในปี 1994

• ทำนายโครงสร้างของโปรตีนที่ยังไม่ทราบโครงสร้าง

• AlphaFold เวอร์ชันแรกเข้าร่วม CASP13 ซึ่งจัดขึ้นในปี 2018

• ใน CASP14 ที่จัดขึ้นในปี 2020 AlphaFold ได้อันดับ 1 ด้วยค่าเฉลี่ย GDT 92.4

• ซึ่งมีความคลาดเคลื่อนประมาณความกว้างของอะตอม 1 อะตอม

ผลที่คาดหวังและแนวโน้ม

• ในปีนี้ AlphaFold ได้ทำนายโปรตีนของไวรัสโคโรนา เช่น ORF3a และ ORF8

• คาดว่าจะมีส่วนช่วยในการแก้ปัญหาทางชีววิทยาหลายด้านและการพัฒนายาใหม่ในอนาคต

[ffdd270]

คงต้องดูแลสุขภาพให้ดีสินะ จนกว่าความฝันเรื่องการยืดอายุขัยจะเป็นจริง... มีหลายอย่างมากที่อยากทำในชาตินี้ ;_;

[xguru]

เคยมีบทความออกมาว่ามีการใช้โปรตีนเพื่อย้อนความชราของเซลล์

ดูเหมือนว่า AI อาจมีบทบาทสำคัญในการทำให้ความฝันเรื่องการยืดอายุขัยเป็นจริงก็ได้

มีการพัฒนาเทคโนโลยี 'ย้อนวัยของเซลล์' ที่ทำให้เซลล์ผิวหนังที่แก่กลับมาอ่อนเยาว์อีกครั้ง

http://m.dongascience.donga.com/news.php?idx=41855

ในบรรดากลยุทธ์สำหรับการย้อนความชราของเซลล์ เทคโนโลยี ‘การย้อนการแยกสภาพ’ เป็นแนวทางที่ได้รับการศึกษากันอย่างแพร่หลายที่สุด การย้อนการแยกสภาพคือเทคโนโลยีที่เติมโปรตีน 4 ชนิดที่เรียกว่า ‘Yamanaka transcription factors’ เข้าไปในเซลล์ที่เติบโตเป็นเนื้อเยื่อเฉพาะของร่างกายแล้ว เช่น เซลล์ผิวหนัง เพื่อย้อนกลับไปสู่สภาพอ่อนเยาว์ก่อนที่จะแยกตัวไปเป็นเซลล์เฉพาะทาง