2 คะแนน โดย GN⁺ 2024-04-21 | 1 ความคิดเห็น | แชร์ทาง WhatsApp
  • มีการยืนยันกรณีที่สาหร่าย Braarudosphaera bigelowii นำไซยาโนแบคทีเรีย UCYN-A เข้าไปอยู่ภายในเซลล์และใช้งานเสมือนเป็นออร์แกเนลล์เดียวกัน จึงได้รับความสนใจว่าเป็นตัวอย่างที่กำลังดำเนินอยู่ของ การอยู่ร่วมกันภายในเซลล์แบบปฐมภูมิ ที่พบได้ยาก
  • การอยู่ร่วมกันภายในเซลล์แบบปฐมภูมิคือกระบวนการที่จุลชีพหนึ่งกลืนจุลชีพอีกชนิด แล้วใช้มันเหมือนอวัยวะภายใน ก่อนที่สิ่งมีชีวิตร่วมอาศัยจะสูญเสียความสามารถในการอยู่รอดอย่างอิสระและกลายเป็น ออร์แกเนลล์
  • ตลอดประวัติศาสตร์ชีวิตบนโลกประมาณ 4 พันล้านปี กรณีขนาดใหญ่ที่เป็นที่รู้จักมีเพียงการเกิด ไมโทคอนเดรีย เมื่อราว 2.2 พันล้านปีก่อน และ คลอโรพลาสต์ เมื่อราว 1.6 พันล้านปีก่อน ซึ่งแต่ละกรณีเป็นจุดเปลี่ยนของวิวัฒนาการสู่สิ่งมีชีวิตซับซ้อนและพืช
  • UCYN-A มีความสอดคล้องกับสาหร่ายเจ้าบ้านทั้งในด้านสัดส่วนขนาด เมแทบอลิซึม และการแบ่งเซลล์ อีกทั้งยังพึ่งพาเจ้าบ้านในการจัดหาโปรตีนที่จำเป็นราวครึ่งหนึ่ง จึงถูกมองว่าเป็นออร์แกเนลล์ชื่อ nitroplast
  • งานวิจัย nitroplast อาจนำไปสู่แนวทางในการนำความสามารถ การตรึงไนโตรเจน เข้าสู่พืช จึงเป็นหัวข้อวิจัยที่คำนึงถึงความเป็นไปได้ในการปรับปรุงพืชผลในระยะยาว

การอยู่ร่วมกันภายในเซลล์แบบปฐมภูมิที่ถูกสังเกตอีกครั้ง

  • นักวิทยาศาสตร์ยืนยันกรณีที่ เหตุการณ์วิวัฒนาการ ซึ่งสิ่งมีชีวิตสองชนิดกำลังรวมกันเป็นสิ่งมีชีวิตเดียวกำลังดำเนินอยู่
  • สิ่งมีชีวิตที่เป็นเป้าหมายคือสาหร่าย Braarudosphaera bigelowii และไซยาโนแบคทีเรีย UCYN-A
  • UCYN-A ทำให้สาหร่ายสามารถทำสิ่งที่โดยปกติทำไม่ได้
    • ตรึง ไนโตรเจนจากอากาศได้โดยตรง
    • นำไนโตรเจนไปจับกับธาตุอื่นเพื่อสร้างสารประกอบที่มีประโยชน์มากขึ้น

กระบวนการที่การอยู่ร่วมกันภายในเซลล์กลายเป็นออร์แกเนลล์

  • การอยู่ร่วมกันภายในเซลล์แบบปฐมภูมิ(primary endosymbiosis) คือปรากฏการณ์ที่จุลชีพหนึ่งกลืนจุลชีพอีกชนิดแล้วใช้มันเหมือนอวัยวะภายใน
  • เซลล์เจ้าบ้านมอบข้อได้เปรียบให้แก่สิ่งมีชีวิตร่วมอาศัย เช่น สารอาหาร พลังงาน และการปกป้อง
  • เมื่อเวลาผ่านไป สิ่งมีชีวิตร่วมอาศัยจะไม่สามารถดำรงชีวิตได้อย่างอิสระอีกต่อไป และตั้งหลักเป็น ออร์แกเนลล์(organelle) ภายในเซลล์จุลชีพ

จุดเปลี่ยนก่อนหน้านี้ที่ไมโทคอนเดรียและคลอโรพลาสต์สร้างขึ้น

  • ตลอดประวัติศาสตร์ชีวิตบนโลกประมาณ 4 พันล้านปี เชื่อกันว่าการอยู่ร่วมกันภายในเซลล์แบบปฐมภูมิที่เป็นที่รู้จักมีเพียงสองครั้ง
  • กรณีแรกเกิดขึ้นเมื่อประมาณ 2.2 พันล้านปีก่อน
    • อาร์เคียกลืนแบคทีเรียเข้าไป
    • แบคทีเรียดังกล่าวกลายเป็น ไมโทคอนเดรีย
    • ไมโทคอนเดรียซึ่งเชี่ยวชาญด้านการผลิตพลังงาน ทำให้วิวัฒนาการของสิ่งมีชีวิตซับซ้อนเป็นไปได้
  • กรณีที่สองเกิดขึ้นเมื่อประมาณ 1.6 พันล้านปีก่อน
    • เซลล์ที่พัฒนามากกว่าดูดซับไซยาโนแบคทีเรียที่สามารถเก็บเกี่ยวพลังงานจากแสงอาทิตย์ได้
    • ไซยาโนแบคทีเรียนั้นกลายเป็น คลอโรพลาสต์
    • คลอโรพลาสต์มอบความสามารถในการใช้แสงอาทิตย์และสีเขียวให้แก่พืช

เหตุใดการรวมตัวของ B. bigelowii และ UCYN-A จึงพิเศษ

  • โดยทั่วไปพืชและสาหร่ายจะอาศัยความสัมพันธ์แบบพึ่งพากับแบคทีเรียที่แยกต่างหากเพื่อรับ ไนโตรเจน
  • ในตอนแรกเชื่อกันว่า B. bigelowii ก็มีความสัมพันธ์แบบพึ่งพาแยกต่างหากเช่นนี้กับ UCYN-A
  • แต่จากการตรวจสอบอย่างละเอียด พบหลักฐานว่าความสัมพันธ์ของสิ่งมีชีวิตทั้งสองใกล้ชิดกว่านั้นมาก

หลักฐานที่ทำให้ UCYN-A ถูกตัดสินว่าเป็น nitroplast

  • ทีมวิจัยหนึ่งยืนยันว่า สัดส่วนขนาด ของสาหร่ายและ UCYN-A ยังคงใกล้เคียงกันในหมู่สปีชีส์สาหร่ายที่เกี่ยวข้อง
    • กระบวนการเติบโตดูเหมือนจะถูกควบคุมโดยการแลกเปลี่ยนสารอาหาร
    • นี่เหมือนกับวิธีที่ไมโทคอนเดรียและคลอโรพลาสต์ปรับให้เข้ากับขนาดของเซลล์
  • งานวิจัยต่อมาใช้เทคนิค การถ่ายภาพด้วยรังสีเอกซ์ อันทรงพลังเพื่อสังเกตภายในเซลล์สาหร่ายที่ยังมีชีวิต
    • การจำลองตัวและการแบ่งเซลล์ของเจ้าบ้านกับสิ่งมีชีวิตร่วมอาศัยเกิดขึ้นอย่างสอดประสานกัน
    • นี่เป็นหลักฐานเพิ่มเติมว่าการอยู่ร่วมกันภายในเซลล์แบบปฐมภูมิกำลังทำงานอยู่
  • ทีมวิจัยเปรียบเทียบโปรตีนของ UCYN-A ที่ถูกแยกออกมากับโปรตีนของ UCYN-A ภายในเซลล์สาหร่าย
    • UCYN-A ที่ถูกแยกออกมาสามารถผลิตโปรตีนที่จำเป็นได้เองเพียงประมาณครึ่งหนึ่ง
    • ส่วนที่เหลือสาหร่ายเจ้าบ้านต้องเป็นผู้จัดหาให้
    • นี่เป็นลักษณะที่ปรากฏเมื่อเอนโดซิมไบออนต์กำลังเปลี่ยนผ่านไปเป็นออร์แกเนลล์
  • จึงมีการตัดสินว่า UCYN-A เป็นออร์แกเนลล์ที่สมบูรณ์ชื่อ nitroplast
  • วิวัฒนาการของ nitroplast ดูเหมือนจะเริ่มต้นขึ้นเมื่อประมาณ 100 ล้านปีก่อน ซึ่งถือว่าสั้นมากเมื่อเทียบกับไมโทคอนเดรียและคลอโรพลาสต์

ความเป็นไปได้ที่จะนำไปสู่การตรึงไนโตรเจนในพืช

  • นักวิจัยมีแผนจะศึกษาต่อไปว่า nitroplast มีอยู่ในเซลล์ชนิดอื่นด้วยหรือไม่ และมีผลกระทบอย่างไร
  • หนึ่งในประโยชน์ที่เป็นไปได้คือการเปิดเส้นทางใหม่ในการนำความสามารถ การตรึงไนโตรเจน เข้าสู่พืช
  • ความสามารถนี้อาจถูกนำไปใช้ในการปลูกพืชผลที่ดียิ่งขึ้น
  • งานวิจัยตีพิมพ์ใน Cell00182-X.pdf) และ Science

1 ความคิดเห็น

 
GN⁺ 2024-04-21
ความคิดเห็นบน Hacker News
  • ผมเรียนชีววิทยาระดับมัธยมปลายมาตั้ง 3 ปี แต่ไม่รู้ทำไมถึงไม่เคยได้ยินว่าเหตุการณ์ที่สิ่งมีชีวิตชนิดหนึ่งดูดกลืนสิ่งมีชีวิตอีกชนิดหนึ่งเข้าไป กลายเป็นต้นกำเนิดของความสามารถอันน่าทึ่งแบบนี้
    เคยเรียนเรื่อง ไมโทคอนเดรีย กับ คลอโรพลาสต์ แต่สอนกันแบบแห้งแล้งมาก
    ถ้าเล่าบริบทแบบนี้ไปด้วย การศึกษาระดับประถม-มัธยมคงทำให้เด็ก ๆ สนใจได้มากขึ้นเยอะ

    • ในบริบทเดียวกัน บทความนี้ก็น่าอ่าน: https://jsomers.net/i-should-have-loved-biology/
    • ขึ้นอยู่กับว่าเรียนเมื่อไหร่
      ทฤษฎีกำเนิดจากเอนโดซิมไบโอซิส ยังมีการค้นหาความเชื่อมโยงที่เกี่ยวข้องกันอย่างต่อเนื่องจนถึงช่วงทศวรรษ 2000
      https://www.nature.com/scitable/topicpage/the-origin-of-mito...
    • จำได้ว่าเคยเรียนเรื่องนี้เกี่ยวกับไมโทคอนเดรียกับคลอโรพลาสต์ในวิชาชีวะเกรด 10 สมัยก่อน
      แต่ถ้าถามเพื่อนมัธยมตอนนี้ โอกาสที่พวกเขาจะจำเนื้อหาบทเรียนนั้นได้คงครึ่งต่อครึ่ง
      ข้อมูลอะไรก็ตามที่เรียนตอนเรียนเรื่องออร์แกเนลล์ในเซลล์ก็น่าจะเหมือนกัน และแม้แต่คำว่า ออร์แกเนลล์ เองก็อาจจำได้แค่ครึ่งต่อครึ่ง
      ถ้าถามโดยไม่มีบทความนี้ ก็คงตอบไม่ได้ด้วยซ้ำว่าเหตุการณ์พวกนี้เกิดขึ้นประมาณเมื่อไหร่
      แต่เพื่อนเก่าทุกคนก็คงจำมีม “โรงไฟฟ้าของเซลล์” ได้แน่ ๆ
    • ภายใต้เงื่อนไขแบบ นักเรียน 25 คนที่ถูกกระตุ้นมากเกินไป, คาบเรียน 45 นาที, และครูค่าจ้างต่ำ การทำให้มันน่าสนใจก็แทบเป็นไปไม่ได้อยู่แล้ว
    • อยากรู้เหมือนกันว่าในโรงเรียนได้เรียนไหมว่าไมโทคอนเดรียมี DNA ของตัวเอง
      และเพราะไมโทคอนเดรียของเรามาจากเซลล์ไข่ DNA ของไมโทคอนเดรียจึงมาจากไมโทคอนเดรียของแม่เสมอ
      หรือไม่ก็อาจเคยเล่น Parasite Eve มาแล้ว [0]
      [0] https://en.wikipedia.org/wiki/Parasite_Eve_(video_game)#Plot
  • เหตุการณ์อยู่ร่วมอาศัยครั้งแรกนั้น ยากกว่าครั้งที่สองหรือสามเป็นล้านเท่า
    ตอนแรก โฮสต์ต้องรับมือกับโจทย์ที่ยากมาก คือการจัดการ DNA และ RNA ที่เกิดขึ้นระหว่างวงจรชีวิตและการตายของสิ่งมีชีวิตร่วมอาศัย
    เพื่อให้รอด โฮสต์ต้องวิวัฒน์สิ่งอย่างนิวเคลียสของเซลล์และการสืบพันธุ์แบบอาศัยเพศขึ้นมา และยังต้องมีการตัดต่อประกอบแบบเลือกได้ เพื่อรับมือกับสภาพที่ยีนทั้งหมดเสียหายเพราะองค์ประกอบพันธุกรรมเห็นแก่ตัวที่มาจากสิ่งมีชีวิตร่วมอาศัย
    หลังจากนั้น การผสานรวมสิ่งมีชีวิตร่วมอาศัยก็ยังยากอยู่ แต่ไม่ถึงขั้นเดียวกับก้าวแรกนั้น
    การอยู่ร่วมอาศัยครั้งแรกที่นำไปสู่กำเนิดของยูคาริโอต อาจไม่ใช่เหตุการณ์หนึ่งครั้งในพันล้านปี แต่อาจหายากระดับหนึ่งครั้งในล้านล้านปี หรือแม้แต่น้อยกว่าหนึ่งครั้งใน 10^20 ปี
    นั่นอาจหมายความว่า ในดาวเคราะห์ที่มีสิ่งมีชีวิตอย่างง่าย 1 พันล้านดวง จะมีเพียงดวงเดียวที่ “สร้าง” ชีวิตซับซ้อนแบบสัตว์ได้ และสิ่งนี้อาจเป็นตัวกรองใหญ่ที่นำไปสู่ ปฏิทรรศน์ของแฟร์มี

    • ผมเริ่มมองแบบนี้มากขึ้นเรื่อย ๆ
      ตัวกรองใหญ่ อาจเป็นสิ่งที่เราผ่านมาแล้วก็ได้ เพราะชุดเงื่อนไขข้อจำกัดที่ทำให้เรามาถึงปัจจุบันนั้นหายากจนแทบไม่น่าเชื่อ
      เหตุการณ์ความน่าจะเป็นต่ำมากอีกอย่างหนึ่งอาจเป็นการพัฒนาของปัญญาเชิงนามธรรม
      เงื่อนไขที่ทำให้ปัญญาแบบของเรากลายเป็นข้อได้เปรียบทางวิวัฒนาการดูจะพิเศษเป็นพิเศษ: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK210002/
  • ถ้าดูจากชื่อเรื่องจะเหมือนเพิ่งเกิดขึ้นเมื่อสัปดาห์ที่แล้ว แต่จริง ๆ แล้วเกิดขึ้น 100 ล้านปีก่อน และเราเพิ่งค้นพบตอนนี้

    • โล่งอกไปที
      ถ้าฟังเหมือนเป็นสปีชีส์ใหม่ที่เพิ่งเกิดขึ้นตอนนี้ คงน่ากลัวมาก
      ผมนึกภาพว่าสปีชีส์แบบนั้นจะครอบงำระบบนิเวศของเรา ทำให้ปั่นป่วน แล้วท้ายที่สุดก็เกิดสมดุลใหม่ ผู้ชนะใหม่ และสปีชีส์ผู้ครองอำนาจใหม่
    • ขอบคุณ
      ผมสงสัยอยู่เหมือนกันว่าโอกาสจะเป็นเท่าไรที่เรื่องหายากขนาดนี้เกิดขึ้นพอดีตอนที่มีคนส่องกล้องจุลทรรศน์อยู่
      ถ้าอย่างนั้น จากที่บทความไม่ได้พูดถึง ก็คงแปลว่าโดยรวมแล้วยังไม่มีอะไรน่าสนใจเกิดขึ้นมากนักสินะ
    • ก็อาจเกิดขึ้นเมื่อสัปดาห์ที่แล้วด้วยก็ได้
    • ใน มาตราส่วนเวลาทางวิวัฒนาการ 100 ล้านปีก่อนก็แทบจะเหมือนสัปดาห์ที่แล้ว
    • มันก็ไม่ใช่เหตุการณ์ที่เกิดขึ้นทันทีเหมือนกัน
      ถ้าความสัมพันธ์แบบอยู่ร่วมอาศัยเริ่มพัฒนาครั้งแรกเมื่อ 100 ล้านปีก่อน เวลาทั้งหมดนั้นอาจถูกใช้ไปกว่าที่แบคทีเรียจะกลายเป็น ออร์แกเนลล์ ที่ต้องพึ่งพาเซลล์สาหร่ายเจ้าบ้านโดยสมบูรณ์เหมือนในปัจจุบัน
  • ดูสาหร่ายที่เป็นประเด็นนี้แล้วดีมาก: https://en.m.wikipedia.org/wiki/Braarudosphaera_bigelowii
    มันห่อหุ้มตัวเองด้วยแผ่นห้าเหลี่ยม 12 แผ่น จนเป็น ทรงสิบสองหน้าแบบปกติ ที่สมบูรณ์
    เป็นสิ่งมีชีวิตที่เจ๋งจนน่าเหลือเชื่อจริง ๆ

    • ว้าว ดูเหมือนของที่ออกมาจาก Stargate เลย
      ไม่น่าเชื่อว่านี่เป็นโครงสร้างตามธรรมชาติและเป็นอินทรีย์ที่มีขอบคมแบบนี้
    • ไดอะตอมสร้าง โครงกระดูกซิลิกอนไดออกไซด์ และหน้าตาเหมือนยานสำรวจอวกาศจิ๋ว
      https://paleonerdish.wordpress.com/2013/06/10/an-introductio...
      https://www.mediastorehouse.com/science-photo-library/diatom...
    • พูดง่าย ๆ คือมันมีโครงกระดูกภายนอกแบบ D12
    • Volvox ก็หน้าตาเท่เหมือนกัน
  • เป็นแหล่งข้อมูลปฐมภูมิ
    [1] https://www.cell.com/cell/pdf/S0092-8674(24)00182-X.pdf
    [2] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38603509/
    มีข่าวประชาสัมพันธ์ของ LBL ด้วย
    [3] https://newscenter.lbl.gov/2024/04/17/scientists-discover-fi...
    [1] เข้าถึงแบบเปิดได้

  • ความเป็นไปได้แบบไหนมากกว่ากัน: เหตุการณ์ที่เกิดขึ้นหนึ่งครั้งในพันล้านปีแล้วบังเอิญเราจับตัวอย่างนั้นได้พอดีเป๊ะ หรือมันเกิดขึ้นบ่อยกว่านั้นมาก แต่เราแค่เห็นกรณีหนึ่งที่โดยปกติไม่ได้มีอิทธิพลหรือเป็นที่จดจำเท่ากับกรณีที่ถูกกล่าวถึง
    การรายงานข่าวแบบเรียกกระแส หนักเกินไปมาก

    • กรณีเฉพาะนี้เริ่มขึ้นเมื่อ 100 ล้านปีก่อน ดังนั้นไม่ใช่สถานการณ์ที่บังเอิญไปอยู่ถูกที่ถูกเวลาพอดี
      symbiogenesis มีกรณีที่เป็นที่รู้จักแค่สองครั้ง คือไมโทคอนเดรียและ plastid ซึ่งรวมถึงคลอโรพลาสต์ด้วย ดังนั้นคำว่า “หนึ่งครั้งในพันล้านปี” จึงพอมีเหตุผลอยู่บ้าง
      ยังมีกรณีอื่น ๆ ที่ถูกสงสัยด้วย: https://en.wikipedia.org/wiki/Symbiogenesis
      endosymbiont เป็นที่รู้จักกันมากมาย
      คือสิ่งมีชีวิตแยกต่างหากที่อาศัยอยู่ในร่างกายหรือในเซลล์ของสิ่งมีชีวิตอื่น และเป็นเงื่อนไขตั้งต้นของ symbiogenesis
      https://en.wikipedia.org/wiki/Endosymbiont
    • “โดยรวมแล้ว ทีมวิจัยกล่าวว่าสิ่งนี้แสดงให้เห็นว่ามันเป็นออร์แกเนลล์ของเซลล์ที่สมบูรณ์ ซึ่งได้ชื่อว่า nitroplast ดูเหมือนว่าจะเริ่มวิวัฒนาการมาตั้งแต่ราว 100 ล้านปีก่อน ซึ่งฟังดูเป็นเวลาที่ยาวนานเหลือเชื่อ แต่เมื่อเทียบกับไมโทคอนเดรียและคลอโรพลาสต์แล้วก็ใกล้เคียงกับชั่วพริบตา”
      เรื่องนี้เกิดขึ้นเมื่อ 100 ล้านปีก่อน ไม่ใช่ในจานเพาะเชื้อในห้องแล็บ
    • ในประวัติศาสตร์ของชีวิต เหตุการณ์นี้เกิดขึ้นจริง ๆ เพียงไม่กี่ครั้ง และอย่างน้อยกรณีที่อยู่รอดมาก็มีเพียงไม่กี่ครั้ง
      แต่ชื่อเรื่องควรปรับแก้สักหน่อย
  • ผมไม่ค่อยเชื่อคำกล่าวที่ว่า primary endosymbiosis หายากขนาดนั้น
    แมลงแทบทั้งหมดมี endosymbiont ที่ถ่ายทอดทางพันธุกรรมได้: https://doi.org/10.3389/fphys.2013.00046

    • นั่นคือ endosymbiosis ในอีกความหมายหนึ่งที่ใช้ในระดับมหภาคมากกว่า
      ตรงนี้หมายถึง endosymbiosis ระดับเซลล์
      การมีแบคทีเรียในลำไส้ กับการที่มันถูกรวมเข้าไปในเซลล์ในระดับโมเลกุลจนกลายเป็นออร์แกเนลล์ ไม่ใช่เรื่องเดียวกัน
      อย่างไรก็ดี ความกังขาต่อการพูดเกินจริงของสื่อก็ถือว่าถูกทาง
      endosymbiosis ลักษณะนี้มีตัวอย่างที่เป็นที่รู้จักดีอื่น ๆ ทั้งแบบปฐมภูมิและทุติยภูมิ
      อาจไม่ใช่การอยู่ร่วมกันปฐมภูมิกับไซยาโนแบคทีเรีย แต่เมื่อเทียบกับกรณีอื่น ๆ ที่เรารู้อยู่แล้ว ก็ยากจะเรียกว่าเป็น “ก้าวกระโดดทางวิทยาศาสตร์” ครั้งใหญ่ในแง่ความเข้าใจหรือความน่าประหลาดใจ
      น่าขันที่การอยู่ร่วมกันระดับเซลล์แบบนี้พบได้แม้ในหมู่ symbiont ในลำไส้ของแมลง และตัวอย่างสุดโต่งที่สุดน่าจะเป็น Mixotricha paradoxa: https://en.wikipedia.org/wiki/Mixotricha_paradoxa
      Hatena arenicola https://en.wikipedia.org/wiki/Hatena_arenicola คล้ายกับการค้นพบครั้งนี้มาก แต่เนื่องจากเป้าหมายไม่ใช่ไซยาโนแบคทีเรียแต่เป็นสาหร่าย จึงเป็น secondary endosymbiosis และอาจน่าสนใจและแปลกประหลาดยิ่งกว่าด้วยซ้ำ
      เรารู้จากจีโนมของ Smybiodinium ด้วยว่าเคยมีเหตุการณ์จับ endosymbiont หลายครั้ง บางส่วนเป็นการอยู่ร่วมกันทุติยภูมิกับสาหร่าย และบางส่วนก็มีความเป็นไปได้สูงว่าเป็นการอยู่ร่วมกันปฐมภูมิกับแบคทีเรีย: https://en.wikipedia.org/wiki/Symbiodinium
  • มีแหล่งข้อมูลที่ดีกว่าถูกโพสต์ไว้ที่นี่ แต่ไม่มีการอภิปราย: https://news.ycombinator.com/item?id=40101317